摘要：为研究人工饲养条件下吉富罗非鱼（Oreochromis niloticus）肠道微生物多样性及其群落结构组成。采用16S rDNA测序技术对罗非鱼肠道前段（IC1段）与后段（IC2段）微生物种群进行分析。结果显示:测序共计获得有效序列118 490条,聚类为793个OTUs（Operational taxonomic units）。在门水平上拟杆菌门（Bacteroidetes）、梭杆菌门（Fusobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）、疣微菌门（Verrucomicrobia）、厚壁菌门（Firmicutes）和放线菌门（Actinobacteria）六个门是优势菌门,占相对丰度的95%以上。差异分析表明,门水平上,IC1段和IC2段梭杆菌门和放线菌门相对丰度存在显著差异;属水平上,仅鲸杆菌属（Cetobacterium）存在显著差异。同时在多样性方面,IC1段的多样性要显著大于IC2段。结果表明吉富罗非鱼肠道不同分段菌群优势菌群的种类相对一致,但是相对丰度存在差异。
